В первом сезоне было по два опенинга и эндинга (для серий 1-15 и 16-25). 
В опенингах и эндингах исполняются песни: Опенинг-1 - Velvet Underworld; Эндинг-1 - Beautiful Alone; Опенинг-2 - Piece of Heaven; Эндинг-2 - It's too late. Автор музыки всех песен - Нисиока Кадзуя

К девушке-хакеру Митиру по невероятной случайности попадает дискета с зашифрованными данными о махинациях министра энергетики. Она оказывается в центре внимания банды убийц "Скальпы", а заодно и команды "Вайсс", получившей новую миссию от Персии. Кульминация событий разворачивается в загородном домике в заснеженных горах, где четверка ребят из цветочного магазина "Котенок в доме" проводят выходные.

В боях без правил с названием "Человеческие шахматы" доведенные до паники люди убивают друг друга на глазах у богачей, делающих на них ставки. Задание Вайсс - убить организатора игры, но прежде его надо еще найти: сложность в том, что лица его не видел никто. В этой серии Ае предстоит не только выйти на арену, но и столкнуться с собственным прошлым и своим смертельным врагом - Рейдзи Такатори, а заодно с его телохранителем - Брэдом Кроуфордом.

"Райот" - это название клуба, элитного публичного дома, в котором богатые клиенты могут делать все, что им заблагорассудится с девушками. Когда-то при расследовании в этом клубе погибла Аска - подруга Ёдзи. И теперь сюда же приводит "Вайсс" новая миссия от Персии. Ёдзи первым вызывается, чтобы проникнуть в клуб и разведать информацию о его владельцах. Внутри его ждет встреча с его собственными воспоминаниями и девушкой, удивительно похожей на пропавшую Аску.

Новая цель Вайсс - банда "Криперс", организовывающая жестокие убийства политиков, сопровождаемые гибелью десятков невинных людей. Судя по данным Критикер, один из лидеров банды - Косэ Коитиро. Когда-то, еще в J-лиге, он был лучшим другом Кэна и, когда казалось, так искренне поддерживал его. В этой серии очередь Сибиряка встретиться со своим прошлым и узнать, прав ли он со своей верой в старого друга, или тот в самом деле жестокий преступник и предатель, достойный смерти.

От переживаний из-за предательства Касэ Кэна отвлекает неожиданная встреча с девушкой Юрико. Скорость, любовь к байкам, спорт, чудесные выходные, разделенные на двоих - привязанность вспыхивает быстро и ярко. И вот уже девушка зовет Кэна бросить все и уехать с ней в Австралию, чтобы там начать новую жизнь. И он почти соглашается... вот только оказывается, что Юрико может стать одной из жертв энергетического напитка Фройдэ. Напиток вызывает привыкание, а следом за ним - жестокую болезнь и смерть; и Юрико уже не может обойтись без него ни дня, а ее тело покрывается язвами. Производители напитка - цели новой миссии Вайсс. И Кэну надо решить: идти ли на миссию или ехать в аэропорт к девушке...

Очередная тварь тьмы - хирург Ёко Сигэми - охотится за невинными жертвами, чтобы вырезать и продавать их внутренние органы. Одной из жертв становится девочка Томоэ Сакура, внешне удивительно похожая на Аю-тян, сестру Фудзимии Аи. Настолько, что тот, увидев ее случайно на улице, едва не попадает под машину. Сакуре повезло: у нее вырезали только одну почку, оставили в живых и выпустили на волю. Но новый заказ от клиента безумного хирурга - на ее же вторую почку и сердце - не оставляет ей шансов. Ее жизнь зависит от того, кто будет быстрее: Ёко Сигэми или Вайсс, получившие миссию на него.

Сакума Сёто - шестиклассник, сын президента почтовой компании - был похищен, но ему удается бежать и совершенно случайно встретить Оми. Оми помогает мальчику, а сам вдруг начинает вспоминать собственное прошлое: к нему возвращается небольшой кусочек из утраченного - память о том, что он и сам был когда-то похищен. Между тем, Сёто пропадает во второй раз, а Вайсс получают миссию - убить его похитителей. Осталось только их найти.
 

На улицах Токио появляются невероятные чудовища, нападающие на людей. С этими происшествиями связана и новая миссия Вайсс, вот только она полна загадок: им озвучили цель, но не назвали имен. Им приходится самостоятельно проводить расследование и выяснять, кто же проводит столь жуткие эксперименты, в результате которых люди теряют разум и мутируют в монстров. В ходе расследований Вайсс впервые сталкиваются с незнакомой им прежде командой Шрайент, охраняющей главу фармацивтической компании "Корин" Масафуми Такатори. Кроме того, в этой же серии впервые в полном составе появляются Шварц.

Миссия, начатая в 8-й серии, продолжается: Вайсс все еще должны найти и убить того, кто превращает людей в чудовищ - владельца фармацевтической фабрики "Корин", сына Рэйдзи Такатори - Масафуми Такатори. И для этого им предстоит сразиться с командой девушек-боевиков Шрайент. Впрочем, этот непростой бой мог бы быть куда сложнее, если бы Масафуми не разозлил отца своими ошибками. В результате необычайные телохранители Такатори Рэйдзи - команда паранормов Шварц - наблюдают за поединком Шрайент и Вайсс со стороны, ни во что не вмешиваясь. И что с того, что над Наги и Тот витают романтические лепестки сакуры...
 

После происшествия с Масафуми Такатори, в агонии прошептавшим "Мамору", к Оми все активнее возвращаются воспоминания. Он видит сны, ищет в сети информацию о семействе Такатори и находит сведения о похищенном мальчике, в котором ему совсем не сложно заподозрить себя самого. И в это же время Персия дает Вайсс новое задание, а следующей целью становится еще один Такатори - Хирофуми Такатори, старший сын Рэйдзи Такатори, организатор охоты на людей. Оми рвется первым "в бой", вызывается быть "засланным казачком", чтобы подобраться первым к Хирофуми Такатори и успеть ему задать свои вопросы... а по пути за ним нечаянно увязывается вечно настойчивая и упрямая Ока. Так они вдвоем оказываются дичью на настоящей охоте...
 

Оми в смятении от раскрывшейся правды, от того, что нашел семью, о которой так долго мечтал и так долго не мог вспомнить. Его родные оказались преступниками и целями Вайсс. И те, кого он привык считать друзьями, должны убить его брата. И решительнее всех - Ая. Оми узнает его тайну, находит больницу и палату с табличкой "Фудзимия Ая", вспоминает, как тот однажды чуть не сорвал миссию в попытке убить Такатори Рэйдзи. Как оказывается - отца Оми. В этой серии Оми предстоит выбрать между родными и друзьями, между состоятельной жизнью и путем справедливости. А между тем настойчивая Ока продолжает добиваться его дружбы и внимания, знакомит со своей матерью, а затем ведет на вечернику "Независимой партии", чтобы познакомить со своим отцом...  Такатори Рэйдзи.

Шульдих, развлекаясь, устраивает свою игру с Оми и Окой. Он рассказывает девочке, что Оми - ее родной брат. А Бомбейца ввергает в смятение и кошмарные сны, заставляя его в полной мере осознать, что он "убийца" собственных братьев. Оми в смятении бросается к Персии - и тот впервые открывает свое лицо и признается, что он тоже родственник Такатори. А именно - Сюичи Такатори. А между тем Шульдих с помощью Наги и Фарфарелло устраивает ловушку для Вайсс. Он ставит целый спектакль, в котором, по его замыслу,  на глазах у Оки в смертельном бою должны столкнуться Оми и трое его друзей из Вайсс. Для этого он похищает Оку и заманивает Вайсс в парк...

После гибели Оки события развиваются быстро и трагически. Кроуфорд завереяет Рэйдзи Такатори, что его дочь убили "Вайсс". Тот устраивает охоту на них, организовывает серию терактов под именем "Weiß". Персия медлит с новыми приказами, в Вайсс растет напряжение. На этом фоне Оми пробалтывается, что Персия - его дядя, Такатори Сюичи. После чего Ая уходит из команды.

Готовясь к своей мести, Ая вспоминает прошлое: последний день рождения Аи-тян, которое они праздновали, и взрыв дома. Он рассчитывает отомстить, но в поджидаемой им машине Такатори оказываются Кроуфорд и Фарфарелло. В то же время остальные трое "Вайсс" в то же время терпят поражение в бою с новыми целями - военным подразделением "Особые силы" Такатори.

В начале серии Вайсс находятся в сложной ситуации: Ая проигрывает бой против Кроуфорда и Фарфарелло, в то время как Ёдзи, Кен и Оми оказываются окружены на свалке и загнаны в ловушку солдатами Особых сил Такатори. В самый критический момент вмешиваются Персия с Манкс: они спасают Аю и привозят его на свалку, к другим. С его вмешательством бой заканчивается в пользу Вайсс. Но это лишь временная победа: уже на следующий день Такатори Рэйдзи избран премьер-министром. Почувствовав силу, Такатори тут же вводит в стране военное положение и комендантский час под флагом борьбы с терроризмом. Он отказывается и от услуг Шварц - кажется, больше они ему не нужны.

Между тем Сюити Такатори, комиссар полиции, собирает вещи. Манкс пытается организовать его побег, но тот в последний момент предпочитает встретиться с братом, чтобы отомстить за свою возлюбленную Кикуно. В то же время Вайсс собираются в свой последний бой - с Такатори Рэйдзи и его армией.
 

На улицах Токио комендантский час, повсюду рыскают Особые силы Такатори. Сакура тайком пробирается в больницу к Ае-тян и впервые видит ее. Сюити является к Рэйдзи Такатори, узнает от него, кто на самом деле отец Оми - и получает смертельную пулю. Вайсс, устроив пожар, пробираются в офис "Независимой партии", добираются до смертельного раненного Персии, получают от него последнюю "официальную" миссию: убить Такатори Рэйдзи. И исполняют ее. Шварц принципиально не вмешиваются.
 

После убийства Такатори прошло время. Вайсс распались и разошлись, пытаясь привыкнуть к новой жизни. Оми продолжает учиться в школе, Ёдзи встречается с девушками, Кен учит детишек играть в футбол, а Ая увез сестру с собой на берег моря и там работает на стройке. Однако "зло" не дремлет: Эсцет посылают новых людей в Японию. Кроме того, старые врагы Вайсс выходыт на тропу войны: Шрайент совершают покушения на жизнь Ёдзи и Кена; в то же время пропадает из больницы Аю-тян. Бывшие члены Вайсс встречаются вновь в подвале "Дома, где живут котята", здесь их находят Манкс, Бирман и Ботан, чтобы объявить о новой миссии: разобраться с историей о похищении девушек.

Новые преступления совершаются в Токио. Прямо на улице при свете дня происходят внезапные возгорания - люди, охваченные пламенем, гибнут за считанные секунды. Вайсс предстоит с этим разобраться, но в неполном составе: Ёдзи, Кен и Оми вернулись к прежней работе; но Ая, поглощенный поисками пропавшей сестры, не собирается возвращаться и вновь становиться убийцей в команде нового Персии. Его находит агент Критикер Ботан и настойчиво уговаривает вернуться.

В магазинчик "Дом, где живут котята" заходит немолодая монахиня Рут, чтобы купить цветов для церкви. Добрая женщина нравится Кену, она напомнила ему его собственную мать - так что он тепло встречает ее, продает ей цветы за бесценок и сам помогает донести покупки до церкви. Но новая миссия посвящена маньяку, убивающему католических священников - так Кен узнает, что Рут угрожает опасность. Тем большая, что убийца - хорошо известный Вайсс Фарфарелло.

Но только по ходу миссии Кену и другим Вайсс предстоит выяснить о тайне, которая связывает добрейшую Рут и одержимого Фарфарелло.

Музыка дьявольского композитора сводит людей с ума, Вайсс предстоит разобраться с ним и его музыкой. А заодно - с бедняжкой Сакурой, влюбившейся в Аю. Она ходит в магазин, чтобы встретиться с ним - обычно безрезультатно, так как Ая ее избегает. Но в этот раз они все-таки встретятся, и девушка, не без помощи сочувствующих ей Ёдзи и Оми, вызовет его на разговор. Но вряд ли она на самом деле хотела бы то, что откроется в этой серии.

В самом ли деле надо убивать тех, кто поступил неправильно? Кто решает, жить преступнику или умереть? Сложные вопросы поднимает перед Оми дьявольский адвокат со сверкающими глазами и определенно паранормальными способностями Кинугава. А между тем при его помощи один за другим выходят на свободу жестокие убийцы и маньяки. Не удивительно, что он становится новой целью Вайсс.
 

Ёдзи снова преследуют воспоминания об Аске. А тем временем в городе снова происходит серия странных и жутких преступлений: обнаружены тела жертв, у которых извлечен позвоночник. В ходе расследования этого дела Вайсс снова сталкиваются с командой Шрайент и Ёдзи наконец-то узнает жестокую правду про то, что стало с Аской и кто такая Ной.

Шварц должны забрать у Шрайент Аю-тян, заинтересовавшую санродзин Эсцет. И трое оставшихся вживых Шрайент торопятся устроить с ее помощью ловушку для Вайсс и отомстить им за смерть Масафуми. Учитывая, что Шварц в бой вмешиваться не планирует, его результат вплоне предсказуем. И, кажется, единственный, кто не равнодушен к судьбе бывших телохранителец Масафуми - это Наги, влюбленный в Тот. Он пытается ее предупредить, но...

Несмотря на то, что Сакура увидела, как Ая убивает, она продолжает любить его. Отращивает длинные волосы, чтобы быть похожей на его сестру, ходит к "Дому, где живут котята" - даже без надежды встретить Аю. Ее мысли слышит Шульдих, просто случайно проезжая мимо, и тогда же задумывает использовать влюбленность девочки в свои целях. В то же время в Японии нарастает хаос, люди ведут себя, словно безумные. И эта обстановка как нельзя лучше подходит Эсцет для организации их ритуала. Так что новые агенты и сами санродзин летят в Токио.

Сюжет близится к развязке. Санродзин прибывают в музей, заканчиваются последние приготовления к ритуалу, Шварц добивают последних агентов Критикер. На этом фоне Сакура (похищенная Шварц) решается спасти Аю-тян и вернуть ее Ае, для чего занимает ее место.

Санродзин пытаются провести ритуал и призвать в тело Аи-тян демона. Вайсс пробираются к месту ритуала, чтобы спасти девочку и заодно помешать ритуалу. У Шварц, как всегда, свои планы. Эта серия завершает историю Первого сезона аниме.